گروه انگل و قارچ‌شناسی همزمان با تاسیس دانشکده علوم پزشکی کاشان در سال 1365 تحت عنوان گروه پاتوبیولوژی آغاز بکار نمود. 7 سال بعد یعنی در سال 1372 به­ عنوان یکی از گروه‌­های اصلی دانشکده شناخته شد و از آن زمان تاکنون تحت عنوان "گروه انگل شناسی و قارچ شناسی پزشکی" به کار خود ادامه می­دهد. در حال حاضر 6 عضو هیئت علمی در سه بخش تک یاخته­ شناسی، کرم شناسی، قارچ شناسی مشغول فعالیت‌­های آموزشی و پژوهشی می‌­باشند.